Kulki magnetyczne Mag Oligo DT do ekstrakcji mRNA, oczyszczania mRNA, kulki magnetyczne, wysoka czystość

Mag Oligo dT Ekstrakcja mRNA Oczyszczanie mRNA

KrótkoWprowadzenie

Kulki magnetyczne Oligo dT to mikrosfery magnetyczne kowalencyjnie pokryte na swojej powierzchni nićmi oligodeoksythymidyny. Ich główna zasada działania wykorzystuje zasadę komplementarnego parowania zasad, gdzie nici Oligo dT specyficznie hybrydyzują i wiążą się z ogonem poliA, charakterystyczną cechą na 3' końcu eukariotycznego informacyjnego RNA (mRNA), umożliwiając szybkie i wysokiej czystości oddzielenie mRNA od całkowitego RNA.

Mówiąc prościej, magnetyczne kulki Oligo dT działają jak "specjalny magnetyczny grzebień", precyzyjnie "ekstrahując" mRNA z ogonem poliA z mieszaniny RNA.

Cechy produktu

Wysoka specyficzność: Specyficznie wiąże się z RNA z ogonem poliA, głównie mRNA, skutecznie usuwając zakłócenia ze strony rRNA i tRNA (które stanowią ponad 95% całkowitego RNA).

Wysoka czystość i integralność: Łagodne reakcje chemiczne i metody mycia bezalkoholowego lepiej zachowują integralność i czystość mRNA, co sprawia, że nadaje się do zastosowań wymagających bardzo wysokiej jakości RNA.

Szybka i prosta obsługa: Cały proces można zakończyć w ciągu 30-60 minut, znacznie szybciej niż tradycyjna metoda chromatografii kolumnowej z celulozą oligo dT i nie wymaga wirowania.

Wysoka przepustowość: Łatwo zautomatyzowany, kompatybilny z formatami 96-dołkowymi, spełniając wymagania zastosowań o wysokiej przepustowości, takich jak sekwencjonowanie.

Wysoka czułość: Odpowiedni do izolacji mRNA z próbek śladowych (np. mała liczba komórek, próbki mikrodysekcji laserowej, sekcje FFPE).

Bezpieczny i przyjazny dla środowiska: Unika stosowania toksycznych odczynników, takich jak fenol i chloroform.

Główne obszary zastosowań

Kulki magnetyczne Oligo dT są niezbędnym narzędziem w prawie wszystkich dziedzinach związanych z badaniami mRNA.

Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS)

RNA-Seq: To najważniejsze zastosowanie. Wzbogacanie mRNA za pomocą magnetycznych kulek Oligo dT do budowy biblioteki sekwencjonowania pozwala na analizę poziomów ekspresji genów, odkrywanie nowych transkryptów i wykrywanie alternatywnego składania. Dla eukariotów jest to najczęstsza metoda przygotowania biblioteki mRNA.

Sekwencjonowanie RNA pojedynczych komórek (scRNA-seq): Na poziomie pojedynczych komórek kulki magnetyczne Oligo dT są kluczem do wychwytywania mRNA uwolnionego po lizie komórek.

Budowa i klonowanie biblioteki cDNA

Oczyszczone mRNA służy jako matryca do syntezy pierwszej nici cDNA, używanej do budowy bibliotek cDNA, klonowania genów i badań funkcjonalnych.

Analiza ekspresji genów

RT-qPCR: Wzbogacanie mRNA, a następnie odwrotna transkrypcja i ilościowy PCR dają bardziej dokładne i czułe dane dotyczące ekspresji genów poprzez usunięcie szumów tła innych niż mRNA.

Northern Blot: Wymaga mRNA o wysokiej czystości jako cząsteczki docelowej do sondowania.

Tłumaczenie in vitro

Używane w bezkomórkowych systemach ekspresji białek, gdzie oczyszczone mRNA bezpośrednio służy jako matryca do syntezy docelowego białka.

Badania i diagnostyka chorób

Odkrywanie biomarkerów: Izolacja mRNA z próbek klinicznych (np. krwi, tkanki nowotworowej) w celu poszukiwania sygnatur ekspresji genów związanych z chorobami.

Wykrywanie patogenów: Niektóre wirusowe RNA również posiadają ogony poliA i mogą być wzbogacane za pomocą magnetycznych kulek Oligo dT w celu wykrycia.

Informacje techniczne

Magnetyczne kulki Oligo dT są wydajnym i niezawodnym narzędziem do oczyszczania mRNA. Znane ze swojej wyjątkowej specyficzności, prostej i szybkiej obsługi oraz doskonałej kompatybilności, stały się nieodzownym elementem w nowoczesnej biologii molekularnej, genomice i badaniach transkryptomicznych, szczególnie w sekwencjonowaniu RNA o wysokiej przepustowości. Ich znaczenie stanie się jeszcze bardziej widoczne wraz z postępem medycyny precyzyjnej i technologii pojedynczych komórek.