Μαγνητικές χάντρες Mag Oligo dT για εξαγωγή mRNA, καθαρισμό mRNA, μαγνητικές χάντρες, υψηλής καθαρότητας

Mag Oligo dT mRNA Extraction mRNA Purifcation

ΣύντομηΕισαγωγή

Οι μαγνητικές χάντρες Oligo dT είναι μαγνητικές μικροσφαίρες που είναι ομοιοπολικά επικαλυμμένες με αλυσίδες ολιγοδεοξυθυμίνης στην επιφάνειά τους. Η βασική τους αρχή χρησιμοποιεί τον κανόνα της συμπληρωματικής ζεύξης βάσεων, όπου οι αλυσίδες Oligo dT υβριδοποιούνται και συνδέονται ειδικά με την ουρά PolyA, ένα χαρακτηριστικό γνώρισμα στο 3' άκρο του ευκαρυωτικού αγγελιοφόρου RNA (mRNA), επιτρέποντας τον ταχύ και υψηλής καθαρότητας διαχωρισμό του mRNA από το συνολικό RNA.

Με απλά λόγια, οι μαγνητικές χάντρες Oligo dT λειτουργούν σαν μια "εξειδικευμένη μαγνητική χτένα", "εξάγοντας" με ακρίβεια το mRNA με μια ουρά PolyA από το μείγμα RNA.

Χαρακτηριστικά Προϊόντος

Υψηλή Ειδικότητα: Συνδέεται ειδικά με RNA με ουρά PolyA, κυρίως mRNA, αφαιρώντας αποτελεσματικά την παρεμβολή από rRNA και tRNA (που αποτελούν πάνω από το 95% του συνολικού RNA).

Υψηλή Καθαρότητα και Ακεραιότητα: Ήπιες χημικές αντιδράσεις και μέθοδοι πλύσης χωρίς αλκοόλ διατηρούν καλύτερα την ακεραιότητα και την καθαρότητα του mRNA, καθιστώντας το κατάλληλο για εφαρμογές κατάντη που απαιτούν εξαιρετικά υψηλή ποιότητα RNA.

Γρήγορη και Απλή Λειτουργία: Ολόκληρη η διαδικασία μπορεί να ολοκληρωθεί μέσα σε 30-60 λεπτά, σημαντικά ταχύτερα από την παραδοσιακή μέθοδο χρωματογραφίας στήλης κυτταρίνης oligo dT και δεν απαιτεί φυγοκέντρηση.

Υψηλής Απόδοσης Συμβατότητα: Εύκολα αυτοματοποιημένο, συμβατό με μορφές πλάκας 96 πηγαδιών, καλύπτοντας τις απαιτήσεις εφαρμογών υψηλής απόδοσης όπως η αλληλούχιση.

Υψηλή Ευαισθησία: Κατάλληλο για απομόνωση mRNA από δείγματα ίχνους (π.χ., μικρός αριθμός κυττάρων, δείγματα που έχουν μικροδιαχωριστεί με λέιζερ, τμήματα FFPE).

Ασφαλές και Φιλικό προς το Περιβάλλον: Αποφεύγει τη χρήση τοξικών αντιδραστηρίων όπως φαινόλη και χλωροφόρμιο.

Κύρια Πεδία Εφαρμογής

Οι μαγνητικές χάντρες Oligo dT είναι ένα απαραίτητο εργαλείο σχεδόν σε όλους τους τομείς που περιλαμβάνουν έρευνα mRNA.

Αλληλούχιση επόμενης γενιάς (NGS)

RNA-Seq: Αυτή είναι η πιο βασική εφαρμογή. Ο εμπλουτισμός του mRNA χρησιμοποιώντας μαγνητικές χάντρες Oligo dT για την κατασκευή βιβλιοθήκης αλληλούχισης επιτρέπει την ανάλυση των επιπέδων έκφρασης γονιδίων, την ανακάλυψη νέων μεταγραφών και την ανίχνευση εναλλακτικής συρραφής. Για τους ευκαρυώτες, αυτή είναι η πιο κοινή μέθοδος για την προετοιμασία βιβλιοθήκης mRNA.

Αλληλούχιση RNA ενός κυττάρου (scRNA-seq): Σε επίπεδο ενός κυττάρου, οι μαγνητικές χάντρες Oligo dT είναι το κλειδί για την καταγραφή του mRNA που απελευθερώνεται μετά τη λύση των κυττάρων.

Κατασκευή και Κλωνοποίηση Βιβλιοθήκης cDNA

Το καθαρισμένο mRNA χρησιμεύει ως πρότυπο για τη σύνθεση της πρώτης αλυσίδας cDNA, που χρησιμοποιείται για την κατασκευή βιβλιοθηκών cDNA, την κλωνοποίηση γονιδίων και λειτουργικές μελέτες.

Ανάλυση Έκφρασης Γονιδίων

RT-qPCR: Ο εμπλουτισμός του mRNA ακολουθούμενος από αντίστροφη μεταγραφή και ποσοτική PCR αποδίδει πιο ακριβή και ευαίσθητα δεδομένα έκφρασης γονιδίων, αφαιρώντας τον θόρυβο του υποβάθρου μη-mRNA.

Northern Blot: Απαιτεί mRNA υψηλής καθαρότητας ως μόριο στόχου για ανίχνευση.

Μετάφραση in Vitro

Χρησιμοποιείται σε συστήματα έκφρασης πρωτεϊνών χωρίς κύτταρα, όπου το καθαρισμένο mRNA χρησιμεύει άμεσα ως πρότυπο για τη σύνθεση της πρωτεΐνης στόχου.

Έρευνα και Διάγνωση Ασθενειών

Ανακάλυψη Βιοδεικτών: Απομόνωση mRNA από κλινικά δείγματα (π.χ., αίμα, ιστός όγκου) για αναζήτηση υπογραφών έκφρασης γονιδίων που σχετίζονται με ασθένειες.

Ανίχνευση Παθογόνων: Ορισμένα ιογενή RNA διαθέτουν επίσης ουρές PolyA και μπορούν να εμπλουτιστούν χρησιμοποιώντας μαγνητικές χάντρες Oligo dT για ανίχνευση.

Τεχνικές Πληροφορίες

Οι μαγνητικές χάντρες Oligo dT είναι ένα αποτελεσματικό και αξιόπιστο εργαλείο για τον καθαρισμό mRNA. Φημίζονται για την εξαιρετική τους ειδικότητα, την απλή και γρήγορη λειτουργία και την εξαιρετική συμβατότητα, έχουν γίνει ένα απαραίτητο συστατικό στη σύγχρονη μοριακή βιολογία, τη γονιδιωματική και την τρανσκριπτομική έρευνα, ιδιαίτερα στην αλληλούχιση RNA υψηλής απόδοσης. Η σημασία τους θα γίνει ακόμη πιο εμφανής με την πρόοδο της εξατομικευμένης ιατρικής και των τεχνολογιών ενός κυττάρου.