Oligo dT magnetyczne koraliki do oczyszczania mRNA

Mag Oligo dT mRNA Ekstrakcja mRNA Oczyszczanie

KrótkoWprowadzenie

Oligodeksytymowe koraliki magnetyczne to mikrosfery magnetyczne pokryte na powierzchni kowalentnie nićmi oligodeoksytyminy.podstawowa zasada komplementarnego sparowania, gdzie nięci Oligo dT specjalnie hybrydyzują się i wiążą się zOgon poliA, charakterystyczna cecha na 3' końcu RNA eukariotycznego posłańca (mRNA), umożliwiająca szybkie i wysokiej czystości oddzielenie mRNA od całkowitego RNA.

Mówiąc prościej, koraliki magnetyczne Oligo dT działają jak "specjalistyczny grzebień magnetyczny", dokładnie "ekstrakcja" mRNA z ogonem PolyA z mieszaniny RNA.

Cechy produktu

Wysoka specyfika:W szczególności wiąże się z RNA z ogonem PolyA, głównie mRNA, skutecznie usuwając ingerencje z rRNA i tRNA (które stanowią ponad 95% całkowitego RNA).

Wysoka czystość i integralność:Delikatne reakcje chemiczne i metody mycia bezalkoholowego lepiej zachowują integralność i czystość mRNA, co czyni ją odpowiednią do zastosowań w dalszym ciągu, wymagających niezwykle wysokiej jakości RNA.

Szybka i prosta obsługa:Cały proces może zostać zakończony w ciągu 30-60 minut, znacznie szybciej niż tradycyjna metoda chromatografii kolumnowej oligo dT celulozy, i nie wymaga odśrodkowania.

Kompatybilność wysokiej przepustowości:Łatwo zautomatyzowane, kompatybilne z 96-dołkowymi formatami płyt, spełniające wymagania aplikacji o wysokiej przepustowości, takich jak sekwencjonowanie.

Wysoka wrażliwość:Odpowiednie do izolacji mRNA z śladowych próbek (np. niewielkie liczby komórek, próbki mikrodysekcji laserową, sekcje FFPE).

Bezpieczne i przyjazne dla środowiska:Unika użycia toksycznych czynników, takich jak fenol i chloroform.

Główne obszary zastosowania

Perły magnetyczne Oligo dT są niezbędnym narzędziem w prawie wszystkich dziedzinach badań nad mRNA.

Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS)

RNA-Seq:Ubogacanie mRNA za pomocą kolczyków magnetycznych Oligo dT do sekwencjonowania biblioteki pozwala na analizę poziomów ekspresji genów, odkrycie nowych transkryptów,i wykrywanie alternatywnego splicinguDla eukariotów jest to najczęstsza metoda przygotowania biblioteki mRNA.

Sekwencjonowanie jednokomórkowego RNA (scRNA-seq):Na poziomie pojedynczej komórki, kolczyki magnetyczne Oligo dT są kluczem do wychwytywania mRNA uwalnianego po lizie komórkowej.

Konstrukcja i klonowanie biblioteki cDNA

Oczyszczone mRNA służy jako szablon do syntezy pierwszego nici cDNA, używany do budowy bibliotek cDNA, klonowania genów i badań funkcjonalnych.

Analiza ekspresji genów

RT-qPCR:Wzbogacenie mRNA, po którym następuje odwrotna transkrypcja i ilościowa PCR, daje dokładniejsze i bardziej wrażliwe dane o ekspresji genów poprzez usunięcie hałasu tła niezwiązanego z mRNA.

Północny Blot:Wymaga wysokiej czystości mRNA jako molekuły docelowej do sondy.

Tłumaczenie in vitro

Używane w systemach ekspresji białek wolnych od komórek, w których oczyszczone mRNA służy bezpośrednio jako szablon do syntezy białka docelowego.

Badania i diagnozowanie chorób

Odkrycie biomarkerów:Wyizolowanie mRNA z próbek klinicznych (np. krwi, tkanki nowotworowej) w celu wyszukiwania sygnatur ekspresji genów związanych z chorobą.

Wykrywanie patogenów:Niektóre wirusowe RNA posiadają również ogony PolyA i mogą być wzbogacone za pomocą koralików magnetycznych Oligo dT do wykrywania.

Informacje techniczne

Podsumowanie

Oligo dT magnetyczne koraliki są wydajnym i niezawodnym narzędziem do oczyszczania mRNA.stały się nieodzownym elementem współczesnej biologii molekularnej, genomiki i transkryptomiki, zwłaszcza w zakresie sekwencjonowania RNA o wysokiej przepustowości.Ich znaczenie będzie jeszcze większe wraz z postępami w medycynie precyzyjnej i technologii jednokomórkowej.