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시퀀싱 세계에서 자기 비드는 큰 존경을 받지 못하지만, 매우 유용합니다. 시도해 볼 만한 몇 가지 응용 분야가 있습니다!

하지만 먼저, 자기 비드는 실제로 어떻게 작동할까요?

비드 자체는 철로 코팅되어 초상자성을 띠는 폴리스티렌 구체입니다.
이것은 '자석에 매우 끌린다'는 멋진 용어입니다. 그리고 자석에 끌리기 때문에 생체 분자의 고처리량 분리에 완벽한 솔루션입니다!

이 철 비드는 다양한 방식으로 기능화될 수 있습니다. 예를 들어, 단백질, 비오틴 또는 핵산을 결합하도록 코팅할 수 있습니다. 이러한 다재다능함은 분자 조작에 매우 유용한 이유입니다!

핵산 추출: 비드는 염 침전된 핵산에 결합할 수 있도록 카르복실기로 기능화됩니다. 이 결합은 폴리에틸렌 글리콜(PEG)과 같은 '크라우딩제'의 도움을 받아 DNA/RNA가 비드와 가까워지도록 합니다! 이것은 기본적으로 고처리량 핵산 추출을 원하는 모든 사람에게 필수적인 과정입니다. 또한 필터 기반 플레이트나 컬럼과 달리 DNA/RNA를 전단하는 것과 달리 매우 부드러운 추출 방법으로, 비드는 60kb 길이를 생성할 수 있어 더 긴 리드 시퀀싱 응용 분야에 적합합니다.

DNA 크기 선택: 하지만, 더 있습니다! 이러한 비드를 사용하여 DNA 크기 선택을 수행할 수도 있습니다. 단편 삽입 크기 길이는 짧은 리드 시퀀싱에 중요하며, 리드 길이에 따라 75bp에서 400bp 사이의 단편 크기를 목표로 할 수 있습니다. 역사적으로 이것은 젤 크기 선택 또는 초음파 처리로 수행되었지만, 비드는 크라우딩제의 농도를 조절하여 단편의 크기 범위를 선택하는 데에도 사용할 수 있습니다! 본질적으로, 더 많은 크라우딩제를 포함할수록 더 작은 단편을 유지합니다.

핵산 정규화: 또는 비드 자체는 크기, 염 농도 및 PEG 비율에 따라 특정 결합 능력을 가지고 있습니다. 이 때문에 이러한 비드는 다음 단계로 넘어가기 전에 얼마나 있는지 정량화할 필요 없이 다운스트림 응용 분야에 특정 양의 핵산을 결합하는 데 사용할 수 있습니다!

타겟 캡처: 비드는 비오틴에 매우 강하게 결합하는 단백질인 스트렙타비딘으로 코팅될 수 있습니다. 이 친화성은 타겟 캡처 응용 분야에 활용되었습니다. 비오틴으로 5' 라벨링된 핵산 프로브는 DNA 샘플과 함께 배양되어 타겟에 결합하고, 스트렙타비딘으로 덮인 자기 비드에 노출된 다음, 세척하여 벌크 샘플에서 캡처된 타겟을 분리합니다.

면역 침강: 또 다른 큰 단어이지만 '항체를 사용하여 무언가를 분리하는 것'을 의미합니다! 자기 비드는 항체를 결합하도록 기능화될 수 있습니다. 그런 다음 샘플에서 특정 세포, DNA 단편에 결합된 단백질을 자기적으로 분리하거나 원하는 친화성 상호 작용을 찾아낼 수 있습니다.

비드의 힘을 존중하세요!