notizie sull'azienda Rispetta il potere della perla!

Le perle magnetiche non godono di molta considerazione nel mondo del sequenziamento, ma sono dannatamente utili. Ecco alcune applicazioni che dovresti provare!

Ma prima, come funzionano effettivamente le perle magnetiche?

Le perle stesse sono sfere di polistirene che sono state rivestite di ferro per renderle superparamagnetiche.
Questo è solo un termine elegante per 'sono molto attratte dai magneti'. E poiché sono attratte dai magneti, le rende la soluzione perfetta per l'isolamento ad alto rendimento di biomolecole!

Queste perle di ferro possono essere funzionalizzate in diversi modi, ad esempio, possono essere rivestite per legare proteine, o biotina, o anche acidi nucleici. Questa versatilità è ciò che le rende così utili per la manipolazione molecolare!

Estrazione di acidi nucleici: Le perle sono funzionalizzate con gruppi carbossilici che consentono loro di legarsi agli acidi nucleici precipitati con sale. Questo legame è favorito da un 'agente di affollamento' come il polietilenglicole (PEG) che costringe il DNA/RNA ad avvicinarsi alle perle! Questo è fondamentalmente il processo di riferimento per chiunque voglia eseguire l'estrazione di acidi nucleici ad alto rendimento. È anche un metodo di estrazione molto delicato, a differenza delle piastre o delle colonne basate su filtro che tagliano il DNA/RNA, le perle possono produrre lunghezze di 60 kb, il che è perfetto per applicazioni di sequenziamento a lettura più lunga.

Selezione della dimensione del DNA: Ma aspetta, c'è di più! Puoi anche usare queste perle in modo simile per eseguire la selezione della dimensione del DNA. La lunghezza della dimensione dell'inserto del frammento è importante per il sequenziamento a lettura breve e, a seconda della lunghezza della tua lettura, potresti voler puntare a dimensioni dei frammenti comprese tra 75 bp e 400 bp. Storicamente questo veniva fatto usando la selezione della dimensione del gel o la sonicazione, ma le perle possono anche essere usate per selezionare intervalli di dimensioni dei frammenti regolando la concentrazione dell'agente di affollamento! Essenzialmente, più agente di affollamento includi, più piccoli saranno i frammenti che conservi.

Normalizzazione degli acidi nucleici: In alternativa, le perle stesse hanno una capacità di legame specifica in base alle loro dimensioni, alla concentrazione di sale e al rapporto PEG. Per questo motivo, queste perle possono essere utilizzate per legare una quantità specifica di acido nucleico per applicazioni a valle senza doversi preoccupare di quantificare quanto ce n'è prima di passare alla fase successiva!

Cattura del bersaglio: Le perle possono essere rivestite con streptavidina, una proteina che si lega molto strettamente alla biotina. Questa affinità è stata cooptata per applicazioni di cattura del bersaglio. Le sonde di acidi nucleici marcate con biotina 5' vengono incubate con un campione di DNA per legarsi ai loro bersagli, esposte a perle magnetiche ricoperte di streptavidina e quindi lavate per isolare il bersaglio catturato dal campione sfuso.

Immunoprecipitazione: Un'altra parola grossa, ma significa semplicemente 'usare un anticorpo per isolare qualcosa!' Le perle magnetiche possono essere funzionalizzate per legare gli anticorpi. Questi possono quindi isolare magneticamente cellule specifiche da un campione, proteine legate a frammenti di DNA o pescare qualsiasi interazione di affinità desideri.

Rispetta il potere della perla!