https://www.linkedin.com/feed/update/urn:li:activity:7298345790605803520/

Các hạt từ tính không được đánh giá cao trong thế giới giải trình tự, nhưng chúng cực kỳ hữu ích. Dưới đây là một số ứng dụng bạn nên thử!

Nhưng trước tiên, các hạt từ tính thực sự hoạt động như thế nào?

Bản thân các hạt là các hình cầu polystyrene đã được phủ sắt để làm cho chúng siêu thuận từ.
Đây chỉ là một thuật ngữ hoa mỹ cho 'chúng rất bị hút bởi nam châm.' Và vì chúng bị hút bởi nam châm, nó làm cho chúng trở thành giải pháp hoàn hảo choviệc phân lập sinh phân tử thông lượng cao!

Những hạt sắt này có thể được chức năng hóa theo nhiều cách khác nhau, ví dụ, chúng có thể được phủ để liên kết với protein, hoặc biotin, hoặc thậm chí là axit nucleic. Sựlinh hoạtnày là điều khiến chúng trở nên hữu ích cho việc thao tác phân tử!

Chiết xuất axit nucleic: Các hạt được chức năng hóa bằng các nhóm carboxyl cho phép chúng liên kết với axit nucleic kết tủa muối. Sự liên kết này được hỗ trợ bởi một 'tác nhân gây dồn' như polyethylene glycol (PEG), chất này buộc DNA/RNA phải tiếp xúc gần gũi với các hạt! Về cơ bản, đây là quy trình được sử dụng cho bất kỳ ai muốn chiết xuất axit nucleic thông lượng cao. Nó cũng là một phương pháp chiết xuất rất nhẹ nhàng, không giống như các tấm hoặc cột dựa trên bộ lọc làm cắt DNA/RNA, các hạt có thể tạo ra chiều dài 60kb, hoàn hảo cho các ứng dụng giải trình tự đọc dài hơn.

Chọn kích thước DNA: Nhưng đợi đã, còn nhiều hơn thế nữa! Bạn cũng có thể sử dụng các hạt này theo cách tương tự để chọn kích thước DNA. Chiều dài kích thước đoạn chèn là quan trọng đối với việc giải trình tự đọc ngắn và tùy thuộc vào độ dài đọc của bạn, bạn có thể muốn nhắm đến bất cứ đâu từ 75bp đến 400bp kích thước đoạn. Trước đây, điều này được thực hiện bằng cách chọn kích thước gel hoặc siêu âm, nhưng các hạt cũng có thể được sử dụng để chọn các phạm vi kích thước của các đoạn bằng cách điều chỉnh nồng độ của tác nhân gây dồn! Về cơ bản, bạn đưa vào càng nhiều tác nhân gây dồn, các đoạn bạn giữ lại càng nhỏ.

Chuẩn hóa axit nucleic: Ngoài ra, bản thân các hạt có khả năng liên kết cụ thể dựa trên kích thước, nồng độ muối và tỷ lệ PEG của chúng. Vì điều này, các hạt này có thể được sử dụng để liên kết một lượng axit nucleic cụ thể cho các ứng dụng hạ nguồn mà không cần phải lo lắng về việc định lượng bao nhiêu trước khi chuyển sang bước tiếp theo!

Bắt mục tiêu: Các hạt có thể được phủ bằng streptavidin, một loại protein liên kết rất chặt chẽ với biotin. Ái lực này đã được sử dụng cho các ứng dụng bắt mục tiêu. Các đầu dò axit nucleic 5' được dán nhãn bằng biotin được ủ với mẫu DNA để liên kết với mục tiêu của chúng, tiếp xúc với các hạt từ tính phủ streptavidin, sau đó rửa để phân lập mục tiêu đã bắt được khỏi mẫu lớn.

Kết tủa miễn dịch: Một từ lớn khác nhưng nó chỉ có nghĩa là 'sử dụng một kháng thể để phân lập một cái gì đó!' Các hạt từ tính có thể được chức năng hóa để liên kết với các kháng thể. Sau đó, chúng có thể phân lập từ tính các tế bào cụ thể từ một mẫu, các protein liên kết với các đoạn DNA hoặc tìm ra bất kỳ tương tác ái lực nào bạn mong muốn.

Hãy tôn trọng sức mạnh của hạt!