https://www.linkedin.com/feed/update/urn:li:activity:7298345790605803520/

Manyetik boncuklar, sıralama dünyasında pek saygı görmezler, ancak son derece kullanışlıdırlar. İşte denemeniz gereken bazı uygulamalar!

Ama önce, manyetik boncuklar aslında nasıl çalışır?

Boncukların kendileri, onları süperparamanyetik yapmak için demirle kaplanmış polistiren kürelerdir.
Bu sadece 'mıknatıslara çok çekilirler' anlamına gelen süslü bir terimdir. Ve mıknatıslara çekildikleri için, onlar için mükemmel bir çözüm haline gelirler.biyomoleküllerin yüksek verimli izolasyonu!

Bu demir boncuklar farklı şekillerde işlevselleştirilebilir, örneğin proteinleri, biyotini veya hatta nükleik asitleri bağlamak için kaplanabilirler. Bu çok yönlülük onları moleküler manipülasyon için bu kadar kullanışlı yapan şeydir!

Nükleik Asit Ekstraksiyonu: Boncuklar, tuzla çöktürülmüş nükleik asitlere bağlanmalarını sağlayan karboksil grupları ile işlevselleştirilir. Bu bağlanmaya, DNA/RNA'yı boncuklarla yakınlaşmaya zorlayan polietilen glikol (PEG) gibi bir 'yığılma ajanı' yardımcı olur! Bu temel olarak, yüksek verimli nükleik asit ekstraksiyonu yapmak isteyen herkes için başvurulacak bir işlemdir. Aynı zamanda, DNA/RNA'yı kesen filtre bazlı plakalar veya kolonların aksine, boncuklar 60kb uzunluklar elde edebilir ve bu da daha uzun okuma sıralama uygulamaları için mükemmeldir.

DNA Boyut Seçimi: Ama durun, daha fazlası var! Bu boncukları DNA boyut seçimi yapmak için de benzer bir şekilde kullanabilirsiniz. Parça ekleme boyutu uzunluğu, kısa okuma sıralaması için önemlidir ve okuma uzunluğunuza bağlı olarak 75bp ile 400bp arasında herhangi bir parça boyutu hedeflemek isteyebilirsiniz. Tarihsel olarak bu, jel boyut seçimi veya sonikasyon kullanılarak yapılıyordu, ancak boncuklar da yığılma ajanının konsantrasyonunu ayarlayarak parça boyut aralıklarını seçmek için kullanılabilir! Esasen, ne kadar çok yığılma ajanı eklerseniz, o kadar küçük parçaları tutarsınız.

Nükleik Asit Normalizasyonu: Alternatif olarak, boncukların kendileri, boyutlarına, tuz konsantrasyonlarına ve PEG oranlarına bağlı olarak belirli bir bağlama kapasitesine sahiptir. Bu nedenle, bu boncuklar, bir sonraki adıma geçmeden önce ne kadar olduğunu ölçme endişesi duymadan, sonraki uygulamalar için belirli bir miktarda nükleik asit bağlamak için kullanılabilir!

Hedef Yakalama: Boncuklar, biyotine çok sıkı bağlanan bir protein olan streptavidin ile kaplanabilir. Bu afinite, hedef yakalama uygulamaları için benimsenmiştir. Biyotin ile 5' etiketli nükleik asit probları, hedeflerine bağlanmak için bir DNA örneği ile inkübe edilir, streptavidin kaplı manyetik boncuklara maruz bırakılır ve daha sonra yakalanan hedefi toplu örnekten izole etmek için yıkanır.

İmmünoprecipitasyon: Yine büyük bir kelime ama sadece 'bir şeyi izole etmek için bir antikor kullanmak!' anlamına geliyor. Manyetik boncuklar antikorları bağlamak için işlevselleştirilebilir. Bunlar daha sonra bir örnekten belirli hücreleri, DNA parçalarına bağlı proteinleri manyetik olarak izole edebilir veya istediğiniz herhangi bir afinite etkileşimini ortaya çıkarabilir.

Boncuğun gücüne saygı gösterin!