εταιρικά νέα για Σεβαστείτε τη δύναμη της χάντρας!

Τα μαγνητικά σφαιρίδια δεν χαίρουν μεγάλης εκτίμησης στον κόσμο της αλληλούχισης, αλλά είναι εξαιρετικά χρήσιμα. Ακολουθούν ορισμένες εφαρμογές που θα πρέπει να δοκιμάσετε!

Αλλά πρώτα, πώς λειτουργούν στην πραγματικότητα τα μαγνητικά σφαιρίδια;

Τα ίδια τα σφαιρίδια είναι σφαίρες πολυστυρενίου που έχουν επικαλυφθεί με σίδηρο για να τα κάνουν υπερπαραμαγνητικά.
Αυτός είναι απλώς ένας φανταχτερός όρος για το 'ελκύονται πολύ από μαγνήτες'. Και επειδή έλκονται από μαγνήτες, τα καθιστά την τέλεια λύση για υψηλής απόδοσης απομόνωση βιομορίων!

Αυτά τα σφαιρίδια σιδήρου μπορούν να λειτουργικοποιηθούν με διάφορους τρόπους, για παράδειγμα, μπορούν να επικαλυφθούν για να δεσμεύουν πρωτεΐνες ή βιοτίνη ή ακόμη και νουκλεϊκά οξέα. Αυτή η ευελιξία είναι αυτό που τα καθιστά τόσο χρήσιμα για μοριακούς χειρισμούς!

Εκχύλιση Νουκλεϊκού Οξέος: Τα σφαιρίδια λειτουργικοποιούνται με καρβοξυλικές ομάδες που τους επιτρέπουν να δεσμεύονται με νουκλεϊκό οξύ που κατακρημνίζεται με άλατα. Αυτή η δέσμευση βοηθάται από έναν 'παράγοντα συνωστισμού' όπως η πολυαιθυλενογλυκόλη (PEG) που αναγκάζει το DNA/RNA να έρθει κοντά και προσωπικά με τα σφαιρίδια! Αυτή είναι βασικά η διαδικασία που πρέπει να ακολουθήσει όποιος θέλει να κάνει εκχύλιση νουκλεϊκού οξέος υψηλής απόδοσης. Είναι επίσης μια πολύ ήπια μέθοδος εκχύλισης, σε αντίθεση με τις πλάκες ή τις στήλες που βασίζονται σε φίλτρα που διατμούν το DNA/RNA, τα σφαιρίδια μπορούν να αποδώσουν μήκη 60kb, κάτι που είναι ιδανικό για εφαρμογές αλληλούχισης μεγαλύτερης ανάγνωσης.

Επιλογή μεγέθους DNA: Αλλά περιμένετε, υπάρχει και κάτι άλλο! Μπορείτε επίσης να χρησιμοποιήσετε αυτά τα σφαιρίδια με παρόμοιο τρόπο για να κάνετε επιλογή μεγέθους DNA. Το μήκος του μεγέθους του ενθέτου θραύσματος είναι σημαντικό για την αλληλούχιση μικρής ανάγνωσης και ανάλογα με το μήκος της ανάγνωσής σας, μπορεί να θέλετε να στοχεύσετε οπουδήποτε μεταξύ 75bp έως 400bp μεγέθη θραυσμάτων. Ιστορικά, αυτό γινόταν με επιλογή μεγέθους γέλης ή ηχοκατεργασία, αλλά τα σφαιρίδια μπορούν επίσης να χρησιμοποιηθούν για την επιλογή εύρους μεγεθών θραυσμάτων προσαρμόζοντας τη συγκέντρωση του παράγοντα συνωστισμού! Ουσιαστικά, όσο περισσότερο παράγοντα συνωστισμού συμπεριλάβετε, τόσο μικρότερα είναι τα θραύσματα που διατηρείτε.

Κανονικοποίηση Νουκλεϊκού Οξέος: Εναλλακτικά, τα ίδια τα σφαιρίδια έχουν μια συγκεκριμένη ικανότητα δέσμευσης με βάση το μέγεθος, τη συγκέντρωση αλάτων και την αναλογία PEG. Εξαιτίας αυτού, αυτά τα σφαιρίδια μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τη δέσμευση μιας συγκεκριμένης ποσότητας νουκλεϊκού οξέος για εφαρμογές κατάντη, χωρίς να χρειάζεται να ανησυχείτε για την ποσοτικοποίηση του πόσο υπάρχει πριν προχωρήσετε στο επόμενο βήμα!

Σύλληψη στόχου: Τα σφαιρίδια μπορούν να επικαλυφθούν με στρεπταβιδίνη, η οποία είναι μια πρωτεΐνη που δεσμεύεται πολύ σφιχτά με τη βιοτίνη. Αυτή η συγγένεια έχει υιοθετηθεί για εφαρμογές σύλληψης στόχου. Οι ανιχνευτές νουκλεϊκού οξέος 5' επισημασμένοι με βιοτίνη επωάζονται με ένα δείγμα DNA για να δεσμευτούν με τους στόχους τους, εκτίθενται σε μαγνητικά σφαιρίδια καλυμμένα με στρεπταβιδίνη και στη συνέχεια πλένονται για να απομονώσουν τον συλληφθέντα στόχο από το χύδην δείγμα.

Ανοσοκατακρήμνιση: Ένα άλλο μεγάλο λόγο, αλλά σημαίνει απλώς 'να χρησιμοποιήσετε ένα αντίσωμα για να απομονώσετε κάτι!' Τα μαγνητικά σφαιρίδια μπορούν να λειτουργικοποιηθούν για να δεσμεύουν αντισώματα. Αυτά μπορούν στη συνέχεια να απομονώσουν μαγνητικά συγκεκριμένα κύτταρα από ένα δείγμα, πρωτεΐνες που συνδέονται με θραύσματα DNA ή να ψαρέψουν οποιαδήποτε αλληλεπίδραση συγγένειας επιθυμείτε.

Σεβαστείτε τη δύναμη του σφαιριδίου!