https://www.linkedin.com/feed/update/urn:li:activity:7298345790605803520/

لا تحظى الخرزات المغناطيسية باحترام كبير في عالم التسلسل، لكنها مفيدة للغاية. إليك بعض التطبيقات التي يجب أن تجربها!

ولكن أولاً، كيف تعمل الخرزات المغناطيسية بالفعل؟

الخرزات نفسها عبارة عن كرات من البوليسترين مطلية بالحديد لجعلها فائقة المغناطيسية.
هذا مجرد مصطلح فاخر يعني 'أنها تنجذب بشدة إلى المغناطيسات'. ولأنها تنجذب إلى المغناطيسات، فإنها تجعلها الحل الأمثل لـالعزل عالي الإنتاجية للجزيئات الحيوية!

يمكن تفعيل هذه الخرزات الحديدية بطرق مختلفة، على سبيل المثال، يمكن طلائها لربط البروتينات، أو البيوتين، أو حتى الأحماض النووية. هذه المرونة هي ما يجعلها مفيدة جدًا للتلاعب الجزيئي!

استخلاص الحمض النووي: يتم تفعيل الخرزات بمجموعات كربوكسيلية تسمح لها بالارتباط بالحمض النووي المترسب بالملح. يتم تسهيل هذا الارتباط بواسطة 'عامل ازدحام' مثل البولي إيثيلين جلايكول (PEG) الذي يجبر الحمض النووي/الحمض النووي الريبي على الاقتراب والتعامل الشخصي مع الخرزات! هذه هي العملية الأساسية لأي شخص يريد إجراء استخلاص الحمض النووي عالي الإنتاجية. إنها أيضًا طريقة استخلاص لطيفة جدًا، على عكس الألواح أو الأعمدة القائمة على المرشح والتي تقص الحمض النووي/الحمض النووي الريبي، يمكن أن تنتج الخرزات أطوالًا تصل إلى 60 كيلو بايت، وهو أمر مثالي لتطبيقات التسلسل ذات القراءات الأطول.

اختيار حجم الحمض النووي: ولكن انتظر، هناك المزيد! يمكنك أيضًا استخدام هذه الخرزات بطريقة مماثلة لإجراء اختيار حجم الحمض النووي. يعد طول حجم إدخال الشظايا مهمًا لتسلسل القراءة القصيرة، واعتمادًا على طول القراءة، قد ترغب في التصوير في أي مكان بين 75 نقطة أساس إلى 400 نقطة أساس من أحجام الشظايا. تاريخيًا، تم ذلك باستخدام اختيار حجم الهلام أو التموجات الصوتية، ولكن يمكن أيضًا استخدام الخرزات لتحديد نطاقات حجم الشظايا عن طريق تعديل تركيز عامل الازدحام! في الأساس، كلما زاد عامل الازدحام الذي تضمنه، كلما كانت الشظايا التي تحتفظ بها أصغر.

تطبيع الحمض النووي: بدلاً من ذلك، تتمتع الخرزات نفسها بقدرة ربط محددة بناءً على حجمها وتركيز الملح ونسبة PEG. ولهذا السبب، يمكن استخدام هذه الخرزات لربط كمية معينة من الحمض النووي للتطبيقات اللاحقة دون الحاجة إلى القلق بشأن تحديد كمية الموجودة قبل الانتقال إلى الخطوة التالية!

التقاط الهدف: يمكن طلاء الخرزات بالستربتأفيدين وهو بروتين يرتبط بإحكام شديد بالبيوتين. تم استيعاب هذا التقارب لتطبيقات التقاط الهدف. يتم حضانة مجسات الحمض النووي 5' المسمى بالبيوتين مع عينة الحمض النووي للارتباط بأهدافها، وتعريضها لخرزات مغناطيسية مغطاة بالستربتأفيدين، ثم غسلها لعزل الهدف الملتقط من العينة المجمعة.

الترسيب المناعي: كلمة كبيرة أخرى ولكنها تعني فقط 'استخدام جسم مضاد لعزل شيء ما!' يمكن تفعيل الخرزات المغناطيسية لربط الأجسام المضادة. يمكنهم بعد ذلك عزل خلايا معينة مغناطيسيًا من عينة، أو البروتينات المرتبطة بشظايا الحمض النووي، أو اصطياد أي تفاعل تقارب تريده.

احترم قوة الخرزة!